Точное происхождение названия «Тепсей» до конца не выяснено. По одной версии, оно переводится как «отмеченная», по другой — связано с тюркским словом «тепси», означающим «поднос» или «блюдо». В древних кыргызских рунических надписях на берегу эта местность упоминается как священное «место переправы».